通常，把包含证券登记结算机构、证券经营机构、投资人三者的清算模式称为二级清算模式；把包含证券登记结算机构、异地资金集中清算中心（异地清算代理机构）、证券经营机构、投资人四者的清算模式称为三级清算模式。三级清算模式适用于异地清算，即由登记结算公司同异地资金集中清算中心（异地清算代理机构）办理一级清算，再由各地资金集中清算中心（各地清算代理机构）同本地证券经营机构办理二级清算，最后由证券经营机构同其客户办理三级清算。